Connect with us

Hi, what are you looking for?

Наука и технологии

Ученые используют пептиды вместо ДНК для маркировки молекул, чтобы ускорить поиск лекарств

Группа химиков из Массачусетского технологического института обнаружила, что использование пептидов вместо фрагментов ДНК для маркировки небольших молекул может ускорить процесс открытия лекарств. Их исследование опубликовано в журнале Science.

Разработка лекарств для лечения или лечения болезней человека, как правило, является длительным и дорогостоящим процессом. Довольно часто все начинается с того, что химики подвергают белки с известными свойствами воздействию большого количества небольших молекул в надежде найти ту, которая прочно связывается.

Часть этого процесса включает в себя предварительную маркировку малых молекул, чтобы идентифицировать их после того, как произойдет связывание. Как правило, это связано с использованием коротких фрагментов ДНК. Однако недостатком использования ДНК является ее чувствительность и несовместимость с некоторыми химическими веществами и катализаторами. В этой новой попытке исследователи стремились найти замену метке, чтобы сделать работу по поиску новых лекарств более эффективной.

В своих поисках исследователи использовали пептиды, поскольку известно, что они полезны в более широком диапазоне условий. Они также обнаружили, что могут ускорить процесс расшифровки с помощью масс-спектрометрии .

Чтобы использовать пептиды в качестве меток, химики сначала иммобилизовали исследуемую небольшую молекулу с помощью смолы. Это создало связь между маленькой молекулой и аминокислотой. Затем реакции проводили итеративно. Чтобы создать библиотеку, смолу разрезали на более мелкие части, каждую из которых обрабатывали по-разному. После того, как реакции были завершены, смолу снова объединяли и разделяли, чтобы можно было провести следующий эксперимент.

Этот подход позволил протестировать большое количество небольших молекул гораздо быстрее, чем это возможно в настоящее время с использованием ДНК в качестве меток. После определения вероятных кандидатов с помощью масс-спектрометра исследователи использовали программное обеспечение для преобразования спектров в уникальную последовательность пептидов. Команда также написала программу на Python для обработки данных.

Исследователи отмечают, что в дополнение к ускорению процесса поиска новых лекарств замена ДНК-меток пептидными метками позволяет создавать более длинные цепочки меток — ДНК позволяет использовать только четыре буквы. Пептиды, с другой стороны, допускают 16.

Ученые используют пептиды вместо ДНК для маркировки молекул, чтобы ускорить поиск лекарств

Теги: биотехнологии

В тренде